叉枝藻一般可以食用，但需注意過敏體質、胃腸功能較弱者慎食，孕婦及嬰幼兒應避免食用。叉枝藻屬于紅藻門植物，含有豐富的膳食纖維和礦物質，但部分人群可能存在食用風險。
叉枝藻含有較多膠質和粗纖維，胃腸消化功能較差的人群過量食用可能導致腹脹或腹瀉。新鮮叉枝藻表面可能附著海洋微生物，需充分清洗并煮熟后食用。部分品種的叉枝藻可能蓄積重金屬，應選擇正規(guī)渠道購買經過檢測的產品。甲狀腺疾病患者需控制攝入量，因其含碘量較高可能影響甲狀腺功能。對海藻類食物過敏者食用后可能出現(xiàn)皮膚瘙癢或呼吸道不適癥狀。
日常食用叉枝藻建議控制單次攝入量在50克以內，可搭配醋或姜汁幫助消化。烹飪前用清水浸泡2小時以上，中途換水2次有助于去除雜質。涼拌時可先用沸水焯燙1分鐘，炒制時需確保完全熟透。不建議與高鞣酸食物如柿子同食，可能影響礦物質吸收。儲存時應保持干燥通風，發(fā)霉變質的叉枝藻會產生有害物質須丟棄。