猴耳草作為中藥材使用時可能存在皮膚過敏、胃腸不適等副作用，孕婦、過敏體質(zhì)者禁用。
猴耳草含有多種生物活性成分，部分人群接觸后可能出現(xiàn)皮膚紅斑、瘙癢等過敏反應(yīng)，嚴(yán)重時可出現(xiàn)過敏性休克。其苦寒特性可能刺激胃腸黏膜，引發(fā)惡心、腹痛或腹瀉，脾胃虛寒者癥狀可能加重。長期過量服用可能影響肝腎功能，表現(xiàn)為尿量異常或乏力。該藥材可能干擾抗凝藥物代謝，增加出血風(fēng)險。個別案例報道顯示，大劑量使用可能導(dǎo)致心律失常。
使用猴耳草前應(yīng)進行過敏測試，出現(xiàn)皮疹立即停用。服藥期間避免辛辣油膩飲食，忌與阿司匹林、華法林等抗凝藥同服。建議在中醫(yī)師指導(dǎo)下控制用量與療程，常規(guī)用量為3-10克煎服，鮮品用量減半。兒童、哺乳期婦女及肝腎功能不全者須謹(jǐn)慎使用，治療期間定期監(jiān)測肝腎功能指標(biāo)。若出現(xiàn)嚴(yán)重嘔吐、心悸或呼吸困難，應(yīng)立即就醫(yī)處理。