樹黃柏的藥用價值主要體現在清熱解毒、瀉火除濕等方面，常用于治療濕熱瀉痢、黃疸尿赤、帶下陰癢等癥狀。樹黃柏的主要藥用成分有黃柏堿、小檗堿、黃酮類化合物等，具有抗菌、抗炎、調節(jié)免疫等作用。
1、抗菌消炎
樹黃柏含有小檗堿等生物堿成分，對金黃色葡萄球菌、大腸桿菌等多種致病菌有抑制作用。臨床可用于治療細菌性痢疾、泌尿系統(tǒng)感染等炎癥性疾病。樹黃柏煎劑或提取物外用可輔助治療皮膚濕疹、瘡瘍腫毒。
2、清熱燥濕
樹黃柏性寒味苦，歸腎、膀胱經，能清除下焦?jié)駸?。對于濕熱下注引起的黃疸、白帶異常、小便赤痛等癥狀有改善作用。常與梔子、車前子等配伍使用，增強利濕退黃功效。
3、降血糖
樹黃柏中的黃柏多糖和黃酮類物質能促進胰島素分泌，提高機體對葡萄糖的利用效率。動物實驗顯示其提取物可降低糖尿病模型動物的空腹血糖，但對人類糖尿病患者的具體療效仍需更多臨床驗證。
4、保肝利膽
樹黃柏可促進膽汁分泌，減輕肝細胞損傷。其活性成分能抑制肝臟纖維化進程，對化學性肝損傷有一定保護作用。在中醫(yī)方劑中常與茵陳、金錢草配伍治療肝膽濕熱證。
5、免疫調節(jié)
樹黃柏提取物能增強巨噬細胞吞噬功能，調節(jié)T淋巴細胞亞群比例。在輔助治療自身免疫性疾病方面具有潛在價值，但具體作用機制和臨床應用方案仍需進一步研究。
使用樹黃柏時需注意其性味苦寒，脾胃虛寒者慎用。建議在中醫(yī)師指導下辨證使用，避免長期大劑量服用。孕婦及過敏體質者應在醫(yī)師評估后使用，出現不良反應應立即停用。日常可配合薏苡仁、茯苓等健脾藥材調和藥性，服藥期間忌食辛辣刺激食物。