益生菌通常建議在飯后服用，飯后胃酸濃度降低更有利于活菌存活，但部分特殊劑型益生菌可能需飯前服用。
飯后胃內(nèi)食物可中和胃酸，使胃部pH值升高，此時(shí)服用益生菌能減少胃酸對(duì)活菌的破壞，提高腸道定植率。多數(shù)益生菌制劑如雙歧桿菌三聯(lián)活菌散、枯草桿菌二聯(lián)活菌顆粒等均建議餐后溫水送服，避免與超過(guò)40℃的液體或食物同服。部分腸溶型益生菌如酪酸梭菌活菌膠囊因具有耐酸包衣，可在飯前空腹服用以快速通過(guò)胃部到達(dá)腸道釋放。服用益生菌期間應(yīng)避免與抗生素同服，若需聯(lián)合使用需間隔2小時(shí)以上。
少數(shù)特殊人群如胃酸缺乏者或服用質(zhì)子泵抑制劑的患者，胃內(nèi)酸性環(huán)境較弱，益生菌存活率較高，飯前飯后服用差異較小。急性胃腸炎發(fā)作期患者若需補(bǔ)充益生菌，通常建議癥狀緩解后餐后服用，避免刺激胃腸黏膜。對(duì)溫度敏感的益生菌粉劑需嚴(yán)格冷藏保存，開(kāi)封后盡快使用以保證活性。
日常補(bǔ)充益生菌需注意選擇正規(guī)廠家生產(chǎn)的活菌制劑，查看保質(zhì)期及儲(chǔ)存條件。飲食上可同步增加酸奶、泡菜、納豆等天然發(fā)酵食品，幫助維持腸道菌群平衡。避免長(zhǎng)期單一補(bǔ)充同種益生菌，可間隔更換菌種類型。若出現(xiàn)腹脹、腹瀉等不適癥狀應(yīng)及時(shí)停用并咨詢醫(yī)生。兒童及免疫力低下者服用益生菌前建議評(píng)估個(gè)體耐受性，家長(zhǎng)需注意觀察服用后反應(yīng)。合理運(yùn)動(dòng)及充足睡眠也有助于改善腸道微生態(tài)環(huán)境。